對于進出口企業來說，如果要抵扣增值稅，就必須通過海關。進出口增值稅的抵扣和正常的國內企業不同，在程序上會有很大的區別。下面是早鴿網顧問的介紹，希望能幫到你。

一、海關增值稅抵扣的程序

1.在簽訂進口貨物合同后的5日內應該到當地的稅務局做備案登記（有的區不用登記）。 

2.海關進口增值稅票為一聯（既是發票聯又是抵扣聯）。 如果你單位沒有進出口權，由報關公司辦理。

3.在申報中會得到一張海關增值稅抵扣表，需按照表格上的要求填寫。

4.進口增值稅發票上的合同號應該是你簽的進口貨物合同號，一致才能抵扣。

5稅票上的增值稅就是你進行抵扣的金額。 

進口增值稅=（貨物價款+關稅+消費稅+運費+保險費）*17％。 

二、海關增值稅抵扣的注意事項

1.海關進口增值稅抵扣的征收系統可以從兩個地方下載。

（1）中華人民共和國國家稅務總局網站--下載中心--軟件下載--征收軟件下載海關完稅憑證抵扣清單。 

（2）網上申報--登錄--軟件下載--下載海關完稅憑證抵扣清單征收系統。

2. 海關進口增值稅的申報、抵扣應在合同簽訂后向主管稅務機關備案，取得海關完稅證明后可申報、抵扣，但最遲不得超過90天。

三、海關增值稅報稅時應帶的材料

1.在系統中打印海關的增值稅扣除清單。

2.進項票復印件及原件。 

3.進口貨物的合同復印件與原件。 

4.貨款支付憑證復印件及原件。