對于進出口企業，要扣除增值稅，必須通過海關。 進出口增值稅的抵扣不同于國內一般企業增值稅的抵扣，在程序上會有很大差異。 下面就由早鴿網顧問介紹一下關于海關增值稅抵扣的相關知識，希望對你有所幫助。

一、海關增值稅抵扣的程序

1.簽訂進口合同后5天內到當地稅務局登記（有的區不用登記）。 

2.取得的海關進口增值稅票就是一聯（既是發票聯又是抵扣聯），如果單位沒有進出口權，是托報關公司辦理的，要上交的臺頭，應該是雙臺頭，也就是公司的名稱跟報關公司的名稱。 

3.征期錄入納稅報表時，在申報系統中，有張海關增值稅抵扣表，按表格上的要求填列。 

4.低扣期從發票開具之日起生效，180天，但付款必須已支付，進口增值稅發票上的合同號應為貴方簽訂的進口貨物合同號，貴方同意后方可扣除。

5.稅收收據上的增值稅是可以扣除的金額。前面的免稅額包括關稅、消費稅、運費和保險。

進口增值稅=(貨物價格+關稅+消費稅+運費+保險費)* 17%。 

二、海關增值稅抵扣的注意事項

1.海關進口增值稅證明扣稅征收系統可從兩地下載。

（1）國家稅務總局網站--下載服務中心--軟件下載--海關完稅憑證扣收清單收集軟件下載。 

（2）網上申報--登錄--軟件下載--海關完稅憑證扣劃清單收集軟件下載。

2.一般在貨物進口環節征收和繳納的增值稅，可以申報扣除。

3.海關進口增值稅的申報抵扣應在合同簽訂后向主管稅務機關備案，取得海關完稅證明后方可申報抵扣，但最遲不得超過90天。