在知識產權領域中，軟件著作權和專利是兩個重要的概念，分別保護著不同的權益，具有各自獨特的特點和適用范圍。

1.法律依據不同。 

軟件著作權的保護主要依據《中華人民共和國著作權法》和《計算機軟件保護條例》。這些法律明確規定了計算機軟件作為著作權法意義上的作品，其著作權人享有的各項權利。專利的保護依據《專利法》，特別是針對涉及計算機程序的發明專利申請，其審查標準參照國家知識產權局專利《審查指南》的相關規定。

2.保護原則與方式。 

軟件著作權在軟件創作完成后自動產生，開發者自愿進行軟件著作權登記，以體現公證的效力，并為后續維權提供更有力的證據。軟件專利必須向國家專利局提出申請，經過形式審查和實質審查后才能獲得保護。

3.申請通過率與下證周期。 

軟件著作權的申請通過率通常較高，只要提交的材料符合形式審查要求，且不違反《著作權法》的規定，即可獲得著作權。軟件專利的申請相對嚴格，需要通過形式審查和實質審查，特別是純軟件型的專利不易獲權；在申請周期上，軟件著作權可以更快地獲得授權，而軟件專利的申請時間則相對較長，通常需要1～2年的時間。

4.保護期限與費用。 

軟件著作權的保護期限通常為作者有生之年加死亡后50年，對于法人及其他組織的作品，其保護期為50年；在費用方面，軟件著作權只需繳納前期的申請費用，后續無需維護費用。軟件專利的保護期限從申請日起算20年，但每年都需要繳納年費，過期不繳納則視為放棄專利權。

5.保護內容與范圍。 

軟件著作權主要保護的是軟件作品的表達形式，即軟件的源代碼和目標代碼等。軟件專利保護的是軟件的設計構思和方案，包括軟件的功能、算法、數據結構等；在保護范圍上，軟件著作權通常僅限于軟件本身，軟件專利則涵蓋使用該軟件的產品或方法。