一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯。丟失前已認證的，購買方可使用賣方提供的相應專用發票復印件和賣方主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票納稅申報證明》或《丟失貨物運輸業專用發票納稅申報證明》作為增值稅進項稅額抵扣憑證；丟失前未認證的，買方憑賣方提供的相應專用發票記賬聯復印件認證。

  《國家稅務總局關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》規定：

1.普通增值稅納稅人真實交易，但因客觀原因導致增值稅抵扣證明逾期的，應經主管稅務機關審核，逐級上報，經國家稅務總局認證，審計和比較，允許納稅人繼續抵扣進項稅額。 因  《國家稅務總局關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》第二條以外的其他原因導致增值稅抵扣憑證逾期的，一般增值稅納稅人仍應遵守增值稅抵扣憑證抵扣期限的有關規定。

2.導致增值稅抵扣證明逾期的客觀原因：

（1）因自然災害、社會突發事件等不可抗力因素導致增值稅抵扣證明逾期的。 

（2）增值稅扣稅憑證被盜、被搶，或者因郵寄過程中丟失、誤遞導致增值稅抵扣證明逾期。 

（3）有關司法、行政機關在辦理業務或檢查過程中扣留增值稅抵扣憑證，納稅人不能正常履行申報義務。 

（4）稅務機關系統或網絡出現故障，未及時處理納稅人網上認證數據，導致增值稅抵扣憑證逾期。 

（5）由于經濟糾紛，買賣雙方未能及時轉交增值稅扣除憑單。 

（6）納稅人更改繳稅地點，以致舊戶口申請新稅的時間過長，導致增值稅扣除憑單逾期的。 

（7）企業納稅人因傷亡、突發重大疾病或擅自離職等原因未辦理交接手續，導致增值稅抵扣憑證逾期的。 

（8）國家稅務管理總局規定的其他情形。