在信息化快速發展的今天，軟件作為推動科技進步和產業革新的重要力量，其知識產權的保護顯得尤為重要。合作開發的軟件由于涉及多個開發者或組織，其軟著申請過程相較于單一開發者開發的軟件更為復雜。

1.明確合作開發軟件的權益歸屬是申請軟著的前提。合作開發的軟件通常涉及多個開發者或組織，因此，在申請軟著之前，各方應就軟件的權益歸屬、利益分配等事宜達成明確的協議。這包括確定軟件的著作權人、各方的權利義務、收益分配方式等，以避免后續發生糾紛。

2.準備軟著申請所需的材料：申請軟著需要提交一系列的材料，包括軟件著作權登記申請表、軟件的鑒別材料、相關的證明文件等。對于合作開發的軟件，應特別注意鑒別材料的準備，確保提交的材料能夠充分展示軟件的原創性和創新性。此外，還需提供合作開發協議、各方身份證明等相關證明文件，以證明軟件的合作開發關系及權益歸屬。

3.在提交申請之前，建議對軟件進行全面的自查和評估。這包括檢查軟件的功能實現、代碼質量、創新性等方面，確保軟件達到申請軟著的基本要求。此外，評估軟件的市場前景和潛在價值，為后續的權益保護和利用提供依據。

4.正式提交軟著申請。申請人通過國家版權局指定的在線平臺或郵寄方式提交申請。在提交申請時，應仔細核對所提交的材料，確保信息的準確性和完整性。此外，關注申請進度，及時響應國家版權局的反饋和要求。