由于軟件作品的特殊性和復雜性，軟著著作權人需要采取一系列措施來保障自己的合法權益。

1.版權登記和備案：軟著著作權人應當及時進行版權登記和備案，以便在出現侵權行為時能夠提供有力的證據。這有助于明確軟著著作權人的權利和邊界，減少爭議和糾紛的發生。

2.選擇可靠的版權代理機構：軟著著作權人可以與可靠的版權代理機構合作，委托其代理軟著著作權的相關事務。這可以幫助軟著著作權人更好地了解和保障自己的權益，同時減少在維權過程中的成本和風險。

3.定期審查和更新作品：軟著著作權人應當定期審查和更新自己的作品，以便及時發現和修復潛在的安全漏洞。這有助于減少因作品存在漏洞而導致的侵權行為，同時提高作品的穩定性和安全性。

4.加強技術保護措施：軟著著作權人可以采取加密、水印、代碼混淆等技術措施來保護自己的軟件作品。這些技術措施可以增加盜版和侵權的難度，有效減少侵權行為的發生。

5.建立維權援助機制：政府和社會可以建立維權援助機制，為軟著著作權人提供法律援助和資金支持。這可以有效降低維權成本，鼓勵更多軟著著作權人積極維護自身權益。

6.加強法律法規的完善和修訂工作：政府可以加強相關法律法規的完善和修訂工作，增加對于軟著著作權人權益的保護力度。同時，還要加強司法公正和透明度，確保軟著著作權人的權益得到公正的保障。

7.增強自我保護意識：軟著著作權人應當增強自我保護意識，了解和學習相關法律法規和政策，以便在遇到侵權行為時能夠及時采取措施進行維權。

8.建立行業自律機制：軟件行業可以建立自律機制，鼓勵企業自覺遵守相關法律法規和道德規范，共同維護行業秩序和健康發展。這有助于減少侵權行為的發生，提高整個行業的自律水平。

9.加強宣傳教育力度：政府和社會應當加強宣傳教育力度，提高公眾對于軟著著作權保護的認知和理解。通過普及知識產權保護意識，減少侵權行為的發生，保障軟著著作權人的合法權益。