在上海市進行公司注冊及運營過程中，企業所得稅和增值稅是最主要的兩種稅種。

一、上海公司注冊后的稅收類別

1.企業所得稅。

企業所得稅是對企業經營所得征收的一種稅。根據企業所得稅法規定，企業應就其生產經營所得和其他所得按照規定的稅率繳納企業所得稅。企業所得稅的稅率根據企業的應納稅所得額確定，稅率為25%。

2.增值稅。

增值稅是對商品或服務的增值部分征收的一種稅。根據上海市的稅收政策，一般納稅人的增值稅稅率為17%，小規模納稅人的增值稅稅率為3%。

二、上海公司注冊后的稅收政策

1.所得稅優惠政策。

根據上海市的稅收政策，對于符合條件的小型微利企業，可以享受企業所得稅優惠政策。具體來說，對于應納稅所得額低于一定標準的小型微利企業，其所得減按50%計入應納稅所得額，按20%的稅率繳納企業所得稅。

2.增值稅優惠政策。

根據上海市的稅收政策，對于符合條件的小規模納稅人，可以享受增值稅優惠政策。具體來說，對于應納稅額低于一定標準的小規模納稅人，可以免征增值稅；對于超過標準的部分，可以減征一定比例的增值稅。

三、上海公司注冊后的稅收實操建議

1.合理規劃稅務結構。

企業在注冊公司前，應該根據自身的業務特點、稅收政策和市場環境等因素，合理規劃稅務結構。例如，可以考慮采用總分公司模式或母子公司模式進行稅務籌劃。

2.依法進行稅務登記和申報。

企業在注冊公司后，應及時進行稅務登記和申報。同時，要按照相關法律法規的規定，及時報送稅務資料和信息。這樣做不僅可以避免違規操作帶來的風險，還有利于企業的稅務管理和長期發展。

3.加強內部稅務管理。

企業應該建立健全的內部稅務管理制度，明確各級管理人員和員工的稅務管理職責和權限。同時，要加強對員工的稅務培訓和指導，提高員工的稅務意識和專業水平。此外，還要建立完善的稅務檔案管理制度，及時收集和整理稅務資料和信息。