如果公司不提交納稅申報表，不進行年度檢驗，會有罰款風險的，至于罰款多少，將根據申請人主體來確定。 

1.公司不審計，不報稅，是不會自動注銷的。但會引起稅務機關的重視，產生罰款和稅收滯納金。

2.納稅人未按照規定期限辦理納稅申報的，或者扣繳義務人、代理人未按照規定期限向國家稅務機關報送代扣代繳、代收代繳稅款報告表的，由國家稅務機關責令限期改正，可以處以二千元以下的罰款；逾期不改正的，可以處以二千元以上一萬元以下的罰款。

3.根據《企業年度檢驗辦法》第十九條規定，企業不按照相關規定接受年度檢驗的，由企業登記機關責令其限期接受年度檢驗。屬于公司的，處以1萬元以上10萬元以下的罰款。屬于分支機構、非公司法人及其分支機構、從事經營活動的外國（地區）企業以及其他經營單位的，處以3萬元以下的罰款。屬于合伙企業、個人獨資企業及其分支機構的，處以3000元以下的罰款。企業在責令的期限內未接受年檢的，由企業登記機關予以公告。自公告發布之日起，60日內仍未接受年檢的，依法吊銷營業執照。

4.根據《企業年度檢驗辦法》第二十條規定，企業年檢隱瞞真實情況或者弄虛作假的，企業登記機關應當責令限期改正。 屬于公司的，處1萬元以上5萬元以下的罰款；情節嚴重的，吊銷營業執照。 屬于分支機構、非公司法人及其分支機構、在中國境內從事經營活動的外國（地區）企業及其他經營單位的，處3萬元以下的罰款。 屬于合伙企業的、個人獨資企業或者其分支機構，處3000元以下的罰款。

5.根據《企業年度檢驗辦法》第二十二條規定，企業登記機關及其工作人員不得對符合條件的企業和不符合條件的企業進行年檢。